Untuk cluster yang memiliki satu atau beberapa signifikan (FDR-adj P Grup yang menampilkan proses metabolisme utama memilih untuk studi tambahan yang memiliki regresi linier di Profil 5 sebenarnya diekspresikan dari tubuh berwarna hitam Clustering gen karena sepupunya perubahan istilah ( jumlah kuadrat normalisasi) di empat kondisi segar memberikan pengayaan dari kelompok gen praktis. 01) kata-kata Go yang diberkahi, nama Go teratas dinyatakan yang memiliki p.adj-layak. Menempatkan Orang cuatro di dalam laju metabolisme glukosa fermentasi, space kontributor gen ergosterol (ERG27, ERG26, ERG11, ERG25, ERG3) sebenarnya diprediksi adalah Ert1, Hap1 dan Oaf1 (Gambar 5E) Dengan construct khusus ini dari banyak linier regresi, prakiraan dari kontrol transkripsi ke gen berkerumun Anda membawa peningkatan dalam kekuatan prediktif versus prediksi semua gen metabolik (Gambar 5E–H, R2: 0,57–0,68). Periksa kebutuhan TF yang berbeda pada prediksi dari profil transkrip tentang tim lebih dari kondisi tambahan, kami menghitung ‘kepentingan TF’ terbaru dari perkalian R2 dari prediksi regresi linier berganda ke jumlah sepupu TF Anda sendiri dari regresi linier (0–langkah 1, ditentukan karena method pembuatan mannequin) dan dapatkan koefisien untuk aktivasi jika tidak represi (+langkah satu jika tidak –1, masing-masing). Beberapa TF ditempatkan untuk mengelola proses tertentu lebih dari beberapa kriteria, seperti Hap1 untuk Orang 4, yang memiliki genetika biosintesis ergosterol (Bentuk 5A), tetapi Grup cuatro umumnya merupakan contoh cluster yang tampaknya memiliki perubahan persyaratan tertinggi untuk TF yang berbeda memiliki kontrol gen dalam berbagai standar. Untuk menemukan informasi mengenai pemilihan lengkap TF yang mengendalikan jenis kelompok ini dari gen, kami selain memasukkan TF kolinear yang belum pertama kali ditemukan dalam kemungkinan variabel, tetapi dapat mengubah TF yang sangat berkorelasi (diilustrasikan oleh a merah- tautan berwarna sesuai dengan nama TF mengenai peta panas Form 5). Untuk memiliki Grup 4, Oaf1 tidak dipilih di seluruh pilihan TF untuk orang mana dan dengan demikian tidak ditemukan dalam prediksi baru yang digambarkan tentang plot antisipasi dari Profil 5E, tetapi berada dalam peta panas karena dikoordinasikan untuk membantu Anda bergabung dengan Hap1 terbaru dengan asumsi mengecualikan Hap1 dari solusi TF, Oaf1 dimasukkan. Karena bagian dari masing-masing dan setiap TF adalah linier dalam regresi ini, peta panas mempromosikan keseluruhan pandangan tentang bagaimana setiap gen diprediksi dikelola oleh lebih banyak TF. Pengelompokan gen dengan ekspresi relatif memberikan mannequin prediksi yang kuat dari gen berkerumun. (A–D) Semua signifikan (P.adj Pengelompokan gen dengan ekspresi relatif memberikan mannequin prediksi yang kuat dari gen berkerumun.(A–D) Semua signifikan (P.adj

Lewati ke konten

Untuk cluster yang memiliki satu atau beberapa secara signifikan (FDR-adj P

Kelompok yang menampilkan proses metabolisme utama dipilih untuk studi tambahan yang memiliki regresi linier di Profil 5 sebenarnya diekspresikan dari fisik berwarna hitam

Pengelompokan gen karena sepupunya berubah dalam istilah (jumlah kuadrat normalisasi) di empat kondisi baru memberikan pengayaan dari kelompok gen praktis. 01) kata-kata Go yang diberkahi, nama Go teratas dinyatakan yang memiliki p.adj-layak.

Menempatkan Individuals cuatro di dalam laju metabolisme glukosa fermentatif, space kontributor gen ergosterol (ERG27, ERG26, ERG11, ERG25, ERG3) sebenarnya diprediksi adalah Ert1, Hap1 dan Oaf1 (Gambar 5E)

Dengan pengembangan khusus ini dari banyak regresi linier, prakiraan dari kontrol transkripsi ke gen yang dikelompokkan membawa peningkatan dalam kekuatan prediktif versus prediksi semua gen metabolik (Gambar 5E–H, R2: 0,57–0,68). Periksa kebutuhan TF yang berbeda pada prediksi dari profil transkrip tentang tim lebih dari kondisi tambahan, kami menghitung ‘kepentingan TF’ terbaru dari perkalian R2 dari prediksi regresi linier berganda ke jumlah sepupu TF Anda sendiri dari regresi linier (0–langkah 1, ditentukan karena method pembuatan mannequin) dan dapatkan koefisien untuk aktivasi jika tidak represi (+langkah satu jika tidak –1, masing-masing). Beberapa TF ditempatkan untuk mengelola proses tertentu lebih dari beberapa kriteria, jak zjistit, kdo vás márád na fruzo bez placenà seperti Hap1 for Individuals 4, yang memiliki genetika biosintesis ergosterol (Bentuk 5A), tetapi Group cuatro umumnya merupakan contoh cluster yang tampaknya memiliki perubahan persyaratan tertinggi untuk TF berbeda yang memiliki kontrol gen dalam berbagai standar. Untuk menemukan informasi mengenai pemilihan lengkap TF yang mengendalikan jenis kelompok ini dari gen, kami selain memasukkan TF kolinear yang belum pertama kali ditemukan dalam kemungkinan variabel, tetapi dapat mengubah TF yang sangat berkorelasi (diilustrasikan oleh a merah- tautan berwarna sesuai dengan nama TF mengenai peta panas Form 5). Untuk memiliki Grup 4, Oaf1 tidak dipilih di seluruh pilihan TF untuk orang mana dan dengan demikian tidak ditemukan dalam prediksi baru yang digambarkan tentang plot antisipasi dari Profil 5E, tetapi berada dalam peta panas karena dikoordinasikan untuk membantu Anda bergabung dengan Hap1 terbaru dengan asumsi mengecualikan Hap1 dari solusi TF, Oaf1 dimasukkan. Karena bagian dari masing-masing dan setiap TF adalah linier dalam regresi ini, peta panas mempromosikan keseluruhan pandangan tentang bagaimana setiap gen diprediksi dikelola oleh lebih banyak TF.

Pengelompokan gen dengan ekspresi relatif memberikan mannequin prediksi yang kuat dari gen berkerumun. (A–D) Semua signifikan (P.adj

Pengelompokan gen dengan ekspresi relatif memberikan mannequin prediksi yang kuat dari gen berkerumun. (A–D) Semua signifikan (P.adj